Az intézet program során a telelési időszakban, november és február között havi egy alkalommal méri fel a Balatonon, a Kis-Balatonon és ezek közvetlen környékén táplálkozó kormoránállományt.
A számlálás során a madarakat az ismert éjszakázóhelyeken azonos időpontban számlálják, ami pontos állományfelmérést tesz lehetővé. Az első évek tapasztalata alapján a Balatonnál a nagy kárókatonák az egyes éjszakázóhelyek között könnyedén válthatnak az aktuális környezeti feltételeknek, illetve emberi zavarásnak megfelelően.
Műholdas nyomkövetési adatok alapján az egyedek az éjszakázó- és táplálkozó területek között igen nagy távolságokat tehetnek meg. Az idei télen a tavalyi mennyiségnél kevesebb nagy kárókatona tartózkodik a térségben. A legutóbbi, januári számláláson összesen 3534 példányt számláltak, ami az elmúlt évek adatai alapján átlagos mennyiség. A korábbi számlálások alapján egy téli hónapban átlagosan egyszerre 3300 nagy kárókatona tartózkodik a Balaton térségében, az egyszerre számlált legnagyobb mennyiség a program kezdete óta egyszer sem haladta meg az ötezer példányt.
A terepi megfigyelések szerint a nagy kárókatonák, más vízterekhez hasonlóan, a Balatonban is nagy mennyiségben fogyasztják az inváziós fekete törpeharcsát. Az ezzel kapcsolatos táplálkozásvizsgálatok jelenleg is zajlanak.